墨累河和达令河是澳大利亚最长的两条河流。这两个河流系统形成墨累-达令盆地,面积100多万平方公里,相当于大陆总面积的14%。最长河流墨累河(MurrayRiver)长2589千米。艾尔湖是靠近大陆中心一个极大的盐湖,面积超过9000k㎡,但长期呈干涸状态。
澳大利亚是全球最干燥的大陆,饮用水主要是自然降水,并依赖大坝蓄水供水。政府严禁使用地下水,因为地下水资源一旦开采,很难恢复。2006-2009年,厄尔尼诺影响扩大,导致降雨大幅减少,澳大利亚各大城市普遍缺水,纷纷颁布多项限制用水的法令,以节水渡过干旱。